В июне 1967 г. был издан приказ Министерства высшего и среднего специального образования РСФСР о назначении руководителем КГУ доктора биологических наук Н. В. Прикладова, профессора Томского университета, работавшего директором
Ботанического сада в Томске.
Высшим органом управления нового вуза стал Ученый совет. Первое заседание Ученого совета состоялось 28 сентября 1967 г., где обсуждались проблемы научной деятельности университета.
Торжественное открытие университета состоялось 1 сентября 1967 года. На это событие не могла не откликнуться ведущая областная газета. В номере«Калининградской правды» от 2 сентября помещена статья, посвященная этому событию.